生物礁按成因类型有：生态礁（ecologic reef）是在相对一段时间内形成的具有坚固的、抗浪的地貌突起的礁体，与狭义的生物礁属同义语；生物丘（bioherm），表示生物成因的、夹于不同灰岩之间的、形态呈透镜状的碳酸盐岩隆，它们大都是由生物原地堆积作用所造成的；
生物层（biostrome），是一种真正的层状体，也是由生物生长所形成的，如贝壳层、富含珊瑚层、板状层孔虫层等；灰泥丘（lime mound），为大量泥晶灰岩的丘状堆积体，为枝状生物的捕集或障积灰泥所形成的。按礁的生长速率与相对海平面变化，可分为退积礁（retrogradation reef），礁的生长速率小于海平面升降变化的速率，礁体生长不断向陆侧迁移；加积礁（aggradation reef），礁的生长速率近于或等于海平面升降变化的速率，礁体向上垂直生长；进积礁（progradation reef），礁体生长速率大于海平面升降变化速率，礁体向海进积增长。