南靖县，意为“南方之静”，以兆吉祥。[5]
商代，属扬州。
周和春秋，为七闽地，战国，为闽越地。
秦始皇三十三年（前214年），全国分为36郡（后扩建为46郡），闽越故地被划为闽中郡，南靖属之。
汉，刘邦承认无诸为闽越王。今南靖一带属闽越国辖地。元封元年（前110年），在闽越故地建置冶县，南靖属之。东汉，更名为侯官县，隶属会稽郡。
三国东吴永安三年（260年），会稽郡南部另建置建安郡，南靖属建安郡侯官县。
晋太康三年（282年），析建安郡部分地域建置晋安郡。设置晋安等8县，南靖属晋安县。
南北朝梁天监年间（502～518年），析晋安县地分建兰水县，南靖属之。
隋开皇十二年（592年），兰水县并入龙溪县，不久龙溪县撤销并入南安县，不久南安撤销；
唐垂拱二年（686年），割泉州南部龙溪县南部原绥安县地域建置漳州，并置漳浦县、怀恩县。今南靖县大部分地域属漳浦、龙溪县。大历十二年（777年），汀州龙岩县归属漳州。漳州辖漳浦、龙溪、龙岩3县，今南靖辖地属3县交界地域。
元至治二年（1322年），析龙溪、龙岩、漳浦3县交界地域建置南胜县，隶属福建省漳州路。至正十六年（1356年），改名南靖县，仍隶属漳州路。
明洪武元年（1368年），漳州路改为漳州府，南靖属之。
清顺治元年（1644年），福王朱由崧（弘光）立于南京，南靖属之。顺治二年，郑鸿逵与黄道周等奉唐王朱聿健（隆武）于福州，南靖属朱聿健据地。顺治三年，大将军孛罗率兵平定闽粤，漳州归清，南靖亦归附。漳州仍设府，隶属福建省布政司，南靖属之。
民国1年（1912年），废府、州、厅，实行省、道、县。分为东路、西路、南路、北路4道；今漳州各县属西路道，南靖属之。民国3年，设置闽海道、厦门道、汀漳、建安道4道。南靖属汀漳道。民国14年，废道，各县直属福建省。
民国21年4月，中国工农红军东路军东征漳州，成立闽南革命委员会，南靖属之。5月，龙岩、南靖、漳平交界处成立南平区苏维埃政府，南靖受其管辖有红畲、半岭、月水、迎坑等地；科岭成立靖北苏维埃政府，受其管辖有南靖、平和、永定、龙岩4县边区地带。