博古特的父母在70年代从克罗地亚移民到澳大利亚，他从小接受桑德灵厄姆的篮球青训计划，2002年他收到堪培拉体育训练机构的奖学金，并为该机构所在的地方职业队效力。[65] 2003年，他前往美国加入犹他大学，[4] 大一赛季打满首发，成为球队核心，场均得到12.5分9.9篮板1.3盖帽。大二赛季场均20.4分12.2篮板1.9盖帽，并被评选为ESPN全美年度最佳球员以及奈史密斯学院年度最佳球员，荣获约翰·伍登奖。[66] 2005年3月，博古特宣布提前参加NBA选秀。[65]
共4张 大学时期
雄鹿时期
2005年NBA选秀，安德鲁·博古特在首轮第1顺位被密尔沃基雄鹿队选中。[64]
2005年7月2日，安德鲁·博古特和雄鹿队正式签约，合同为期4年价值2029万美元。[64]
2006年2月2日，NBA公布参加2006年全明星周末新秀挑战赛球员名单，安德鲁·博古特入选一年级队。[5]
2006年5月5日，NBA官方公布2005-06赛季最佳新秀阵容名单，安德鲁·博古特入选最佳新秀阵容第一阵容。博古特平均每场得到7.0个篮板和0.83次封盖，排在所有新秀首位。[6] 共10张 雄鹿时期
2005-06新秀赛季，博古特的表现不及预期，虽然展现了作为优秀内线的细节，打满82场常规赛，入选最佳新秀第一阵容，并且帮助球队打进季后赛，成为继大卫·罗宾逊、克里斯·韦伯、蒂姆·邓肯之后首位新秀赛季打进季后赛的状元秀。[75]
2007年2月1日，NBA公布参加2007年全明星周末新秀挑战赛球员名单，安德鲁·博古特入选二年级队。[7] 2006-07赛季，博古特将个人数据提升到场均12.3分8.8篮板3助攻，但赛季末的伤病使他连续66场首发的纪录戛然而止，3月7日他在对阵洛杉矶湖人的比赛中扭伤左脚，并且在训练中再度受伤，雄鹿决定让他缺席剩余赛季的全部比赛。[74]
2008年7月12日，安德鲁·博古特和雄鹿队签订续约合同。合同为期5年价值6000万，2009年生效，2014年到期。[8] 2007-08赛季，伤愈回归的博古特以78场常规赛出勤，成为雄鹿出场次数最多的球员。但场均14.3分9.8篮板2.6助攻的表现比二年级赛季并未有明显提升。[72] 赛季结束，雄鹿决定与博古特续签5年7250万美元的新合同。[73]
2009-10赛季，安德鲁·博古特场均拿下15.9分10.2篮板2.5封盖，作为球队内线核心把雄鹿重新带回季后赛。[67] 该赛季，博古特有19场比赛得分超过20分，2010年1月26日对阵达拉斯独行侠的比赛，他14投13中拿下32分，命中率高达92.9%。[68] 赛季末，博古特再次受伤，2010年4月3日对阵菲尼克斯太阳的比赛，他在一次快攻中与斯塔德迈尔相撞，扣篮落地时摔伤了手臂，手肘脱臼并且扭伤了手腕，导致他缺席余下的赛事。[69] 5月7日，NBA官方公布2009-10赛季最佳阵容名单，安德鲁·博古特入选最佳阵容第三阵容。[9]