恺撒里昂的名字全称为托勒密·菲洛帕托尔·菲洛墨托尔·恺撒（希腊语：Πτολεμαίος Φιλοπάτωρ Φιλομήτωρ Καίσαρ），其中“托勒密”（Πτολεμαίος）是托勒密王朝历代国王（法老）的名字，意为“喜好战争的”、“崇尚武力的”；“菲洛帕托尔”（Φιλοπάτωρ）是绰号，意为“笃爱父亲的”；“菲洛墨托尔”（Φιλομήτωρ）也是绰号，意为“笃爱母亲的”；“恺撒”（希腊语：Καίσαρ，拉丁语：Caesar）是其生父尤利乌斯·恺撒的名字，原意是“浓密的头发”。有时，他也被叫做托勒密·恺撒（希腊语：Πτολεμαίος Καίσαρ，拉丁语：Ptolemaeus Caesar），但是最常用的则是他的昵称恺撒里昂（希腊语：Καισαρίων，拉丁语：Caesarion），意为“小恺撒”。
从亚历山大里亚到罗马
公元前47年6月23日，恺撒里昂出生于亚历山大里亚。
克利奥帕特拉女王对外宣称恺撒是她儿子的父亲，并且希望恺撒指定恺撒里昂为尤利乌斯家族的继承人和罗马共和国未来的领袖。但是恺撒拒绝了，他选择了他的甥孙和养子屋大维。而恺撒里昂则被预定为名义上的埃及和罗马、东方和西方共同的统治者（指克利奥帕特拉和恺撒）的继承人，但是这个身份徒有虚名，随着恺撒的遇刺化为乌有。
恺撒遇刺
恺撒里昂出生不久，就随父母一起来到了罗马共和国的首都罗马（今意大利首都罗马市）。从公元前47年到公元前44年，他和父母都在罗马。而公元前44年3月15日其父恺撒遇刺时，他和母亲也很可能仍在罗马，并亲历此事。
从罗马到亚历山大里亚
恺撒遇刺后，女王母子马上回到埃及。公元前44年7月26日，女王的弟弟、名义上的丈夫和共治国王托勒密十四世死于恶疾（也有说法他是被女王毒死的。），女王开始单独执政。同年9月2日，女王立儿子恺撒里昂为共治国王（法老）。在罗马，恺撒遇刺后，养子屋大维和部将马克·安东尼、雷必达三人联合组成后三头同盟，消灭了共同的敌人共和派，并瓜分了共和国的最高权力。把雷必达排挤后，屋大维为了笼络安东尼，让他统治共和国东方的领土，还把妹妹屋大维娅嫁给他。但公元前42年，安东尼和女王在塔尔苏斯邂逅，和恺撒一样为女王的美色所惑，两人很快坠入情网，开始在亚历山大里亚实行联合统治，还生了一个儿子和一个女儿，把屋大维娅抛之脑后。安东尼实际上成了恺撒里昂的继父。为了巩固统治，安东尼和女王下令杀掉了被囚禁的前敌对女王阿西诺亚四世。不过安东尼在亚历山大里亚待了没多久，便离开埃及开始东征帕提亚。
前37年，安东尼东征归来。他重申了与女王的关系，把妻子屋大维娅休了，并强调亚历山大里亚才是他的家。安东尼和女王按照埃及的习俗共结连理，但不为罗马人所承认。这也为安东尼和屋大维的决裂埋下伏笔。两人结婚后又生了一个儿子。公元前34年末，安东尼东征亚美尼亚归来，宣布把共和国东方的领土全部赠给女王和他们俩的孩子：女王和恺撒里昂分别加上“众王之女王”和“众王之王”的称号，并成为埃及和叙利亚的共治者；安东尼和女王的三个孩子也分到了亚美尼亚、米底、帕提亚、昔兰尼亚、利比亚、腓尼基和奇里乞亚，此举被称为“亚历山大里亚的赠礼”。更有甚者，安东尼还宣布恺撒里昂为尤利乌斯·恺撒的亲生儿子和合法继承人，这对在罗马以恺撒养子和合法继承人自居并统治着共和国西方的屋大维来说无疑是巨大的挑衅，两人正式决裂。