在2010年9月之前，香港及澳门符合资格的居民（即在香港/澳门出生或曾以港澳居民身份赴台），如要申请单次入台证，需要先在相关网页填写资料，然后持收件编号、有效期六个月以上之香港特别行政区护照或英国国民（海外）护照及香港身份证/有效期六个月以上之澳门特别行政区护照或1999年前取得之葡萄牙护照及澳门身份证正本到中华旅行社，中华旅行社的香港国际机场办事处/澳门台北经济文化中心领取临时入境停留通知单。当时入台证有效期为三个月，费用为港币七十五元，可出入境两次，每次停留三十天。只可在台湾桃园国际机场、高雄国际机场或台中清泉岗机场出入境；预先办理入台证者，可以通过小三通或两岸包机出入台湾地区。
2010年9月起，港澳居民进行网上申请手续后，只要自行打印入境通知单即可，不需要付款及预先再到机场或相关单位领取入台证，此举几乎等同于免签证待遇。然而，如非合资格的港澳居民或申请其他种类的入台证，仍然需要亲身到台北经济文化办事处（香港）/台北经济文化办事处（澳门）办理申请手续。现时经网上办理入台证的港澳居民，入台证有效期为三个月，可以停留最多十五天，但只可以出入境一次，之后要再重新在网上申请。而大陆居民赴台旅行则由旅行社代办，一般为持大陆居民往来台湾通行证离开大陆后在台湾边检窗口领取证件，并配合大陆签发的通行证一并查验。
一、入台证的照片要求如下：
（1）1年内拍摄；
（2）照片尺寸：2寸（3.5cmx4.5cm），脸部需占据整张照片的70%-80%（脸部长度在3.2cm~3.6cm）；
（3）需白色背景拍摄，相纸冲印；
（4）对焦需清晰且鲜明，自然显现出皮肤的色调，有合适的亮度及对比；
（5）五官需清晰可见，不可被头发遮盖，且脸型两侧、两耳轮廓及眉毛需清楚呈现，表情自然、双唇紧闭，相片不修改；