壶菌门菌物的营养体形态变化很大，从呈球形或近球形的单细胞至发达的无隔菌丝体。比较低等的壶菌是多核的单细胞，具细胞壁，大多呈球形或近球形，寄生在寄主细胞内的，其营养体在发育的早期没有细胞壁，有的壶菌单细胞营养体的基部还可以形成假根；较高等的壶菌可以形成发达或不发达的无隔菌丝体。
壶菌门菌物无性繁殖时产生游动孢子囊，游动孢子囊有的有囊盖，成熟时囊盖打开释放游动孢子；有的无囊盖，通过孢子囊孔或形成出芽释放游动孢子。每个游动孢子囊可释放多个游动孢子。有性生殖大多产生休眠孢子囊，萌发时释放1至多个游动孢子。
壶菌门菌物有性生殖方式有多种，大多是通过两个游动孢子配合形成的接合子经发育形成休眠孢子囊；少数通过不动的雌配子囊（藏卵器）与游动配子（精子）的结合形成卵孢子。
壶菌门属于真菌界（Fungi），只有一个壶菌纲（Chytridiomycetes），分为5个目，112属，已记载的有793个种，其中只有少数壶菌目（Chytridiales）真菌是高等植物上的寄生物，较重要的如引起玉米褐斑病的玉蜀黍节壶菌（Physoderma maydis），引起马铃薯癌肿病的内生集壶菌（Synchytricum endobioticum）和引起车轴草冠瘿病的车轴草尾囊壶菌（Urophylactis trifolii）。此外，芸薹油壶菌（Olpidium brassicae）是许多高等植物根部的专性寄生菌，对植物生长的直接影响虽然不大，但它的游动孢子是传播一些土壤中病毒的介体。
壶菌目菌物的营养体为单细胞，球形或近球形，有的有假根，或在膨大细胞间有细丝相连接，但不形成典型的无隔菌丝体。多数壶菌目真菌在基质内或寄主细胞内生活，有些为外生的。内寄生的壶菌目真菌营养体发育早期不具细胞壁，为裸露的原质团，后期形成几丁质的细胞壁。我国较常见的是玉蜀黍节壶菌。
蕈类包括菌柄、菌盖和产生孢子的菌褶等三个部分。菌盖高于地面，这样散落的孢子就可以被空气气流带走。菌柄的底部有许多叫作菌丝的细线，蕈类就是通过它们来寻找养料的
节壶菌属（Physoderma）
节壶菌属的特征是休眠孢子囊扁球形，黄褐色，具有囊盖，萌发时释放出多个游动孢子。它们都是高等植物的专性寄生菌，侵染寄主常引起病斑稍隆起，但不引起寄主组织过度生长。
节壶菌属最常见的种是玉蜀黍节壶菌（P. maydis），侵害玉米引起玉米褐班病。病部呈褐色隆起的斑点，内有大量黄褐色粉状物，是病菌的休眠孢子囊。休眠孢子囊扁球形，萌发时囊盖打开，从盖的孔口出释放出游动孢子。游动孢子在寄主表皮上游动一个时期后休止，产生细胞壁，以后萌发侵入寄主。侵入时产生假根进入寄主细胞吸取养料，寄主外部的菌体发育成薄壁的孢子囊。孢子囊成熟时释放出游动孢子，这种游动孢子的个体较休眠孢子囊所产生的小，可以直接侵入寄主，也可以作为配子。两个游动配子配合形成合子侵入寄主，在寄主组织内形成膨大的、具细胞壁的营养体，膨大的细胞之间有丝状体相连。以后膨大细胞的壁加厚，转变为休眠孢子囊，膨大细胞壁间的丝状体随之消失。休眠孢子囊在干燥的土壤和寄主组织中可以存活3年。休眠孢子囊萌发的适温较高（20~30℃），所以玉米褐斑病在我国的南方发生较重。