1、指进士科。《宋史·选举志一》：“开宝三年（970年），诏礼部阅贡士及十五举尝终场者，得一百六人，赐本科出身。”
2、犹今科。商衍鎏《清代科举考试述录》第三章第三节：“倘有因丁忧或别项事故，而不能于本科殿试者，可以声明事由告假，谓之告殿，准其于下一二科补殿试。”
3、高等学校中的正科。相对于预科而言。巴金《灭亡》第六章：“李静淑到上海的时候，她的哥哥已经是N大学本科二年级生了。她也考入这个大学的预科。”
1928年的《中华教育词典》解释说：“对预科而言。学校内学级编制，于预科之上，冠以本科，以便修毕预科学业者，进研专科学问，如师范本科，大学本科之类是。”现亦相对于高等学校的专科而言。如：你读大学本科还是专科？ “本科”英文为“Undergraduate”，而该词意为“还未拿到学士学位或类似学位的大学生”，所以《教育学名词》把它译为“大学本科生”。
根据高考录取批次的不同，本科也分为一本、二本、三本，但它们同属于一个层次和等级（即本科教育层次）。同时本科又分为“重点本科高校”与“普通本科高校”。“重点本科高校”与“普通本科高校”只是侧重不同，无本质差别，前者注重理论研究后者注重理论实践应用。普通高等教育指主要招收高中毕业生进行全日制学习的学历教育，是“中国高等教育储干培养计划”最具权威的措施之一，也是“中国高等教育高层次人才培养方案”的主要措施。 普通本科生毕业证书样本
中国高等教育储干培养计划之下的本科办学等级（部属、省属、市属）的不同、本科办学体制以及性质（公办、民办）的不同，由办学体制决定的本科学费高低的不同，本科（一本、二本、三本）各大学毕业证书“本簿和颜色”的相同与不同等等与本科高校的层次和“学历、文凭”水平的高低无关，所以一本、二本、三本高校是具有相同本科学历和文凭的高校，只是侧重不同，重点本科高校（985、211高校）重理论研究，普通本科高校（普通一本、二本、三本高校）重理论应用。即重点本科重研究，普通本科重应用。
普通三本院校与传统一、二本（包括重本、普本）院校的区别：
1.高考中本科按录取批次顺序划分为三个批次，一本（包括重本、普本）为第一批次、二本为第二批次、三本为第三批次。
2.普通三本和普通一、二本在本质上没有什么区别（都是普通本科层次的高校，没有高低之分，所谓的普通三本只不过是录取先后批次顺序排在第三）。