该所主要从事野蚕（柞蚕、樗蚕、天蚕）、农作物（玉米、花卉、樱桃等）水产（鲍鱼、对虾、扇贝）的转基因育种、分子标记、基因定位、克隆、序列检测分析、生物进化及亲缘关系分析和病毒载体构建、外源基因表达、动植物细胞组织培养及柞蚕的综合利用等研究。开展对农业转基因生物及其产品进行安全评价与检测、监测的工作。
为进一步拓宽我所业务范围，了解最新科研动态，我们积极开展与国际间的合作与交流，五年来，我们先后共选派多名科研人员赴美国、日本、印度、瑞典、法国等国家进行合作研究、进修学习和技术考察等；接待来自美国、加拿大、日本、韩国等国家外宾和专家学者50余人次，并多次参加国内、国际大型学术会议，这不仅提高了科技人员的业务素质，也推动了我们的研究工作。
此外，我们利用所拥有的技术力量和设备条件，对外开放实验室。五年来，分别与大连理工大学、西南农业大学、大连医科大学、辽宁师范大学、沈阳师范大学、沈阳农业大学等多家院校和单位开展合作，先后有30多位硕士或博士研究生在此完成或部分完成了毕业论文，这不仅增加了我所的知名度，也拓宽了我们的合作领域，为今后的科学研究工作创造了有利条件。
目前，我所科研工作要紧密围绕院“十一五”科技发展规划中为全面提升科技创新能力的总体战略目标，在立足所情，考虑所况的前提条件下，重点以建设省野蚕重点实验室和农业转基因生物检测机构为主线，构建两个技术平台，并以此为契机，利用我们已拥有的技术基础、人力资源和设备储备，采取与企业或相关院所联合的方式，开展以柞蚕应用研究为特点的科研项目。
研究所设有基因工程研究室、蛋白质工程研究室、植物基因工程研究室及综合办公室。
研究所配备有DNA合成仪、测序仪、PCR热循环仪、紫外分光光度仪、进口超速和高速离心机、进口低温真空冷冻干燥机及大型活动冷库等设备。
（1）柞蚕核型多角体病毒
柞蚕核型多角体病毒（ApNPV）载体表达系统的构建
柞蚕NPV载体表达系统基因工程的研究始于1985年。经过多年的努力，克隆了柞蚕NPV多角体蛋白基因，并进行了DNA序列分析，确定了该基因的转录起始位点，构建转移表达载体。同时还建立对柞蚕NPV敏感的樗蚕蛹精巢细胞株系。1992年，在昆虫细胞和柞蚕蛹体内表达外源基因获得成功，初步建成了柞蚕NPV载体表达系统。同年申请国家发明专利，并于1997年获得国家专利局的专利授权（专利号92103655.8）。