微囊藻毒素Microcystins（MC）是由蓝藻水华，如固氮的鱼腥藻（Anabaena）、束丝藻（Aphanizomenon）、拟柱胞藻（Clindrospermopsis）、胶刺藻（Gloeotrichia）和节球藻（Nodularia），非固氮的微囊藻（Microcystis）、颤藻（Oscillatoria）和鞘丝藻（Lyngbya）等暴发所产生的一种肝毒素，它对蛋白磷酸酶1 和蛋白磷酸酶2A 具有抑制作用，因此与肿瘤促进作用有直接关系。[2] 蓝藻系统发育树
随着中国水体的富营养化程度逐渐加剧，蓝藻水华和赤潮的发生逐渐增加。80% 的蓝藻水华都可以检测出次生代谢产物---微囊藻毒素（microcystins，MCs），它对水体环境和人群健康的危害已成为全球关注的重大环境问题之一。微囊藻毒素为七肽单环肝毒素，结构中存在着环状结构和间隔双键，因而具有相当的稳定性。[4] 它能够强烈抑制蛋白磷酸酶的活性，当细胞破裂或衰老时毒素释放进入水中，同时它还是强烈的肝脏肿瘤促进剂。中国生活饮用水卫生标准（GB 5749-2006）的颁布，将饮用水中微囊藻毒素含量限制为1μg/L，该标准的实施对水源水的质量提出了更高的要求。[5]
历史上最早的关于微囊藻素对人类的毒害作用可追溯到1000多年前的中国，当时诸葛亮记载了他的部队从中国南部的一条发绿（推测可能是蓝藻）的河流中取水饮用而中毒死亡。[6] 关于这种藻毒素引起人类肠胃炎的最早报道见于1931年，发生在沿美国Ohio河的一系列城镇，当时，由于降水量少，Ohio河的一个支流发生了蓝藻水华，水华随后流入干流，随着其向下游的移动，引发了一系列的疾病，而这些都不能归结为传染源。在津巴布韦的Harare市，生活在从一个特定的水库供水的某一区域的儿童，每年都发生肠胃炎，但找不到感染源，但其时间刚好与该水库的微囊藻水华分解同步，而在该城市使用其它供水的儿童则未出现肠胃炎。[8] 杭州市某水库质谱测定
1996年2月巴西一血液透析中心由于使用了含MC污染的水作肾透析液，使126例病人出现急性和亚急性肝毒性的症状和体征，造成60人死亡，其中多数死于肝脏衰竭。MC污染还可造成野生动物、家畜、家禽等中毒死亡，已成为当前国际公共卫生学家及生物学家共同关注的热点课题[1] 。
中国也有许多饮用水源发生蓝藻水华并检测出MC，特别是2007年发生了太湖大面积暴发蓝藻水华导致震惊世界的无锡市饮用水污染的事件。蓝藻污染不仅会恶化水质，还可能释放出水溶解性肝毒素、神经毒素及其它毒素，其中危害最大的是由铜绿微囊藻、水华鱼腥藻和颤藻等蓝藻产生的微囊藻毒素（microcystins，MCs）。流行病学调查显示，饮用水源中微囊藻毒素是中国南方一些地区原发性肝癌发病率高的主要原因之一。[9]