山东晨曦化工研究院成立于2009年9月17日，由中国石油大学（华东）与山东晨曦集团有限公司共建“山东晨曦化工研究院”。 揭牌仪式
根据协议，山东晨曦化工研究院是企业化运作的非盈利性组织，实行院长负责制。由中国石油大学（华东）与山东晨曦集团有限公司共同组成一个高效、精干、团结的科研领导班子，另聘请5～7名专家组成专家委员会，为确定前沿性课题、技术开发方向等提供论证、咨询和服务。
研究院下设综合管理部、石油化工研究所、精细化工研究所、生物化工研究所等机构。各研究所实行所长领导下的课题负责人制，根据双方要求，重点发挥中国石油大学（华东）科研、人才、信息等优势，开展课题研究，进行技术攻关；建立和完善科技成果共享机制，建设期间，研究院的知识产权双方共享；建立良好的合作机制，建立人才交流机制，优势互补，互利共赢，将合作制度化、长期化。
按照规划，双方将致力于将山东晨曦化工研究院建成省级工程技术研究中心，积极申报国家级工程技术研究中心；争取国家批复博士后科研工作站；争取在国家项目、山东省重大计划项目方面有较大突破；争取成为国家和山东省石油化工行业重要的技术创新、人才培训和教育培育基地。