朱聿键为明太祖第二十三子唐定王朱桱的后裔，是明太祖朱元璋的九世孙。万历三十年四月初五日（1602年5月25日），生于唐王府，母妃毛氏。[1] [2]
朱聿键的祖父老唐王朱硕熿惑在嬖妾，心里一直爱惜小妾生的儿子，憎嫌朱聿键之父（当时的唐王世子朱器墭）。于是，他暗中把朱聿键父子囚禁在承奉司内，想活活饿死他们。幸亏暗中有个小官张书堂帮忙送些糙米饭，在囚房中，朱聿键父子苟活了十六年。身处牢笼，朱聿键埋头苦读，钻研儒学典籍，没有浪费光阴。朱聿键的父亲气息奄奄，在快要熬出头时，却被急切想袭唐王王位的弟弟在1629年（崇祯二年）毒死。老唐王准备封爱妾的儿子为世子，还想取消了朱聿键的世子地位。结果，地方官员陈奇瑜吊唁唐世子时，警告老唐王说，世子死因不明，贸然改变世袭人选，说不定朝廷日后会怪罪。老唐王害怕日法追究，赶忙立朱聿键为“世孙”。同年老唐王也去世。[3] [4]
1632年（崇祯五年）朱聿键继为唐王，封地南阳。崇祯帝赐其皇明祖训、大明会典、五经四书、二十一史、通鉴纲目、忠孝经等书。朱聿键在王府内起高明楼，延请四方名士。
此时的朱聿键锋芒毕露，在宗室换授等问题上与崇祯朝臣多有冲突，得罪了不少大臣。为父当年被毒死一事报仇，竟在1636年（崇祯九年）七月初一，杖杀两位叔父福山王朱器塽（死）、安阳王朱器埈（未死）。当年八月，清朝王爷阿济格率兵攻打北直隶等地，清兵入塞连克宝坻，直逼北京，京师戒严。朱聿键心切，上疏请勤王，崇祯帝不许，竟不顾“藩王不掌兵”的国规，招兵买马，自率护军千人从南阳北上勤王。行至裕州，巡抚杨绳武上奏，崇祯帝勒令其返回，后朱聿键没有遇到清军，却中途和农民军交手，乱打几阵，互有胜负，乃班师回南阳。明朝对藩王防备极严。依照明朝规制，藩王尽可在王府内享乐，惟独不能兴兵拥将离开藩属。即使朱聿键动机纯粹，仍使当时在位的崇祯帝大怒，冬十一月下部议，废为庶人，派锦衣卫把这位唐王关进凤阳皇室监狱。崇祯帝改封其弟朱聿鏼为唐王。[5]
朱聿键高墙圈禁期间，凤阳守陵太监索贿不得，用墩锁法折磨，朱聿键病苦几殆。熬了七年，终于能保住生命。1643年（崇祯十六年）明朝的凤阳巡抚路振飞到当地巡视，前往监狱拜见朱聿键。朱聿键当时已经被磨掉许多锐气，待路振飞彬彬有礼，使后者对他好感非常，并派人对这位唐王加以特别护理。后路振飞向崇祯帝上疏陈高墙监吏凌虐宗室状况，请加恩赐宗室。下旨杀欺凌唐王之陵监石应诏。[5]