伯克利音乐学院于1945年由麻省理工学院的钢琴和作曲教师劳伦·伯克（Lawrence Berk）创建。[3] [4] 学院初名Schillinger House，是美国第一所将爵士乐作为基础课程的大学级别学校。[3] 学院创办之初，影响力十分有限。在开学的第一年，只招收到一名学生，劳伦·伯克倾囊相授，将当时并不为主流社会所接受的爵士乐知识教给这名学生。随着流行音乐在欧美的流行，由于教授流行音乐、爵士乐的音乐学校并不多，伯克利音乐学院一时成为少有的专业学校，吸引了许多的有志于现代音乐的学生，开始快速发展壮大起来。在20世纪50年代，伯克利音乐学院又增添了乡村音乐、[3] 蓝调以及摇滚乐课程，增强了自身教学的全面性。[4]
伯克利音乐学院首个校区——纽伯里街284号
1954年，在学校成立十周年之际，Schillinger House更名为Berklee School of Music，由Berk校长以他的儿子Lee Eliot Berk的名字命名。1962年，学院创建了第一个提供摇滚和流行音乐的大学水平课程。[3] 20世纪60年代中期，通俗音乐在欧美获得了广泛的市场，伯克利音乐学院顺应时势，增添了通俗歌曲写作课程，使音乐创作者能够充分利用先进的技术设备和音乐制作室来录制他们的作品。[4] 1966年，学院的第一个学士学位授予了13 名音乐教育学生和3名作曲学生，其中包括《辛普森一家》的著名作曲家阿尔夫·克劳森。[3]
1970年，学院在成立25周年之际更名为Berklee College of Music。1971年，艾灵顿公爵在该学院的毕业典礼上获得了第一个荣誉博士学位。1979年，伯克利音乐学院建立了世界上第一个电影配乐本科学位课程。同年，Lee Eliot Berk接替他的父亲劳伦·伯克，被任命为伯克利的第二任校长。[3] 20世纪80年代，多媒体技术出现并传入波士顿，伯克利音乐学院由于课程的特殊性，成为最早一批引入多媒体技术进行音乐教学的美国高校之一。[4] 1984年，伯克利音乐学院开设了世界上第一个大学水平的音乐合成专业（后更名为电子制作与设计）。1987年，学院创立了世界上第一个大学水平的歌曲创作专业。[3]