本书所收四十九部佛书中，有若干部系罕见之佛典。兹列举如次： 因明论理门十四过类疏
(1)《大乘僧伽吒法义经》
(2)《清净毗奈耶最上大乘经》
(3)《双峰山曹侯溪宝林传》（除卷六）
(4)《传灯玉英集》
(5)《成唯识论述记科文》
(6)《因明论理门十四过类疏》
(7)《因明正理门论疏》
(8)《瑜伽师地论义演》
(9)《大唐开元释教广品历章》
(10)《大中祥符法宝录》
(11)《天圣释教总录》
(12)《景祐新修法宝录》
(13)《观弥勒菩萨上生兜率天经疏》
(14)《上生经疏会古通今新钞》
由于这批珍本成书时间在《赵城金藏》运抵北平之前，未经战乱损毁，因此，其版本价值和完整性无与伦比。就学术研究而言，此书堪称《赵城金藏》之姊妹篇，可互见阅览。
另详：分类详细目录（不单单由以上目录，三时学会所辑偏重于唯识与瑜伽理论）
上集 第一函
大圣殊师利菩萨佛刹功德庄严经三卷 唐 释不空 译
大方广如来藏经一卷 唐 释不空 译
金刚顶经一字顶轮王瑜伽一切时处念诵成佛仪轨一卷 唐 释不空 译
金刚顶降三世大仪轨法王教中观自在菩萨心眞言一切如来莲华大曼茶罗品一卷 唐 释不空 译
修习若波罗蜜菩萨观行念诵仪轨一卷 宋 释施护 译
佛说十力经一卷 唐 释勿提提犀鱼 译
佛说回向轮经一卷 唐 尸罗达摩 译
佛说胜义空经一卷 宋 释施护 译
佛说清净心经一卷 宋 释施护 译
佛说十地经九卷 唐 释尸罗达摩 译
金色童子因缘经十二卷 宋 释惟净 译 宋 释法护 译
佛说开觉自性般若波罗密多经四卷 宋 释惟净 译
上集 第二函
诸法集要经十卷 宋 释日称 等译
父子合集经二十卷 宋 释日称 等译
佛说大乘僧伽吒法义经三卷 宋 释日称 等译
佛说清净毗奈耶最上大乘经二卷 宋 释智吉祥 等译
佛说随勇尊者经一卷 宋 释施护 等译
仁王般若陀罗尼释一卷 唐 释不空 译
观心论一卷 隋 释智顗 撰
大唐正元续开元释教録三卷 唐 释圆照 撰
上集 第二~三函
御制莲华心轮廻文偈颂二十五卷 宋 太宗赵匡胤 撰