1958年， 《海南师范专科学校学报》创办，是海南创办最早的高等学校学报。
1983年，该学报更名为 《海南师范学院学报》，分为自然科学版和社会科学版。
1987年，《海南师范学院学报（自然科学版）》正式独立创刊。
2008年， 该刊经中国原国家新闻出版署批准，更名为 《海南师范大学学报（自然科学版）》，并以季刊发行。[1][4]
2014年12月，该刊成为中国原国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊。[6]
报道内容
《海南师范大学学报（自然科学版）》主要刊载具有较高水平的自然科学方面的基础理论研究、应用研究、述评和综述等学术论文。[1]
主要栏目
《海南师范大学学报（自然科学版）》设有数学研究、物理学研究、化学与化工研究、生命科学研究、地理科学研究、教育教学研究等栏目。[1]
根据2019年1月《海南师范大学学报（自然科学版）》编辑部官网显示，学报编辑委员会委员有27人，责任编辑1人，排版员1人。[2][3]
2018年1月11日，召开海南师范大学学报编辑委员会会议。在会上编辑委员会其他委员就如何更好地办好学报，加强学报与学科共同发展提出了建议，该学报领导指出学报应该凝练方向，办出特色，使学报成为展示海南师范大学科研水平的窗口。[7]
据2019年1月6日中国知网显示，《海南师范大学学报（自然科学版）》共出版文献1964篇。[4]
据2019年1月6日万方数据知识服务平台显示，《海南师范大学学报（自然科学版）》载文量为1945篇。[5]