北仑历史悠久，于今小港街道横山下、柴桥街道沙溪蛇山山麓下等处均已发现新石器时代人类居住遗迹。
北仑区文化遗存属河姆渡文化系，境内在新石器时代已有先民居住。
夏、商、周时，按《禹贡》九州之说，属扬州之域。
春秋时，为越国地。
战国时，楚灭越，属楚国江东郡。
秦王政二十五年（公元前222年），秦置郡县，北仑属会稽郡鄮县东境。
两汉至南北朝不变，仍属会稽郡鄮县。
隋开皇九年（589年），灭称，废会稽郡，并鄞、鄮、余姚三县入句章，北仑随鄮县并入句章县。
唐武德四年（621年），析句章为鄞州、姚州，原鄞、鄮、句章县地属鄞州，北仑属鄞州东境。武德八年（625年），废鄞州置鄮县，北仑属鄮县东境。开元二十六年（738年），分鄮县为鄮、慈溪、奉化、翁山四县，以地属四明山区，设明州以统之，北仑属明州鄮县。元和四年（809年），分鄮县东境至甬江的海口地区设望海镇（今镇海区和北仑区），仍属鄮县。
后梁开平三年（909年），改鄮县为鄞县，原属鄮县东境的望海镇，升为望海县，今北仑区域大部分属鄞县东境，唯小港镇属望海县崇邱乡。
宋太宗太平兴国初，改称定海县。熙宁十年（1077年），划鄞县灵岩、泰邱、海宴三乡归定海县（即今新碶、大碶、霞浦、柴桥、白峰、郭巨、三山、梅山等乡镇）。元丰元年（1078年），划定海县金塘乡隶昌国县（即今舟山市定海区）。
明洪武十七年（1384年），废昌国县，改为昌国卫。洪武二十年（1387年），废昌国卫为昌国乡，移卫于象山县三部海口东门，隶定海县。
清康熙二十六年（1687年），定海县更名为镇海县，北仑为镇海县甬江南岸地区。次年，立昌国故址为新定海县。
民国三十八年（1949年）5月，北仑大部分区域解放，10月废除保甲制，改建村闾制，北仑区域为镇海县之长山区、柴桥区。 北仑行政区划