“柯尔克孜”是民族的自称，也是其他民族对该民族的称呼，国外同源民族被汉译称作“吉尔吉斯”。
“柯尔克孜”含义有多种不同的解释：
一说是四十的复数，可解释为“四十‘百户’”，也就是四十个部落；
一说是“山里的游牧人”，还有“山中的乌古斯人”、“依山傍河之人”、“草原人”的说法；
也有说“柯尔克”是四十，“克孜”是“姑娘”，“柯尔克孜”就是四十个姑娘[1] 。
柯尔克孜族的历史可以追溯到两千年前。《史记·匈奴列传》最早出现了对柯尔克孜族的先民的记载。约公元前3世纪末，匈奴征服的北方诸族中，就有“鬲昆”，《汉书》作“隔昆”，“鬲昆”或“隔昆”即柯尔克孜族的先民，“鬲昆”是当时柯尔克孜的译音。从《史记》的记载看，当时的“鬲昆”居住在匈奴以北，在今蒙古人民共和国以北的吉尔吉斯湖周围，其活动地区为阿辅水（阿巴根河）与剑水（叶尼塞河）之间。
唐代以前，柯尔克孜族主要从事游牧和渔猎。至唐代，柯尔克孜族有了很大发展，人口达数十万，其中胜兵八万。他们虽然仍以牧业为主，但农业生产已有一定程度的发展。他们能用铁制造兵器，使用十二生肖纪年，反映出古代柯尔克孜族社会经济文化在当时北方各民族中，是比较先进的。柯尔克孜语属于阿尔泰语系突厥语族。公元5、6世纪时，受突厥汗国统治，柯尔克孜族使用过古突厥文。柯尔克孜族地处匈奴西部，汉朝时被匈奴冒顿单于征服。此后又先后为鲜卑、柔然等族所统治。
隋唐之际，柯尔克孜族被称为“契骨”，最早受突厥的统治并与突厥有姻亲关系。贞观初，突厥被唐太宗击破，契骨归附于薛延陀。当时契骨分属于三个酋长，尚无统一的政治机构，薛延陀可汗派一俟利发失钵屈阿栈为都督，隶属于燕然都护府。此后数十年中，与北方各族、与唐朝都保持了良好的关系。到唐肃宗乾元（758-760）年间，契骨为回纥打败，臣服于回纥，此后被称为黠戛斯。9世纪20年代，黠戛斯在其首领阿热领导下，逐渐强盛，并发动了反抗回鹘统治的斗争。这场斗争坚持了二十多年，公元840年，阿热乘回鹘汗国统治集团发生内讧及遭受灾荒的时机，在回鹘大将句录莫贺引导下，发十万大兵侵袭回鹘汗国，杀可汗诛掘罗勿，迫使回鹘各部离开故土，南下西迁。以阿热为首的黠戛斯统治集团在原回鹘汗国领土基础上，建立起了强大一时的黠戛斯汗国，建都于牢山（约今叶尼塞河上游萨彦岭）以南赌蒲（约今图瓦）地区。
《辽史》称黠戛斯作辖戛斯。至10世纪时，契丹族兴起，黠戛斯成为契丹政权辽的属国，辽在辖戛斯设“辖戛斯国王府”。1124年耶律大石西逃，经过辖戛斯地区时，肆意劫掠，遭到辖戛斯人的截击和驱逐。