《阵之书》原文记载，志村团藏为了实现自己对忍者的理想的需要，成立了暗部养成部门。这个组织位于木叶的影子底下，将树根深深扎进黑暗里，最大的目的就是在暗中消灭会妨碍村子繁荣的障碍。为此，他们执行任务时不择手段，这正象征着团藏的“忍之黑暗”，是一个无情且残酷的组织。[1]
团藏认为猿飞日斩在继任火影后没能有效治理宇智波一族，于是团藏选择背负起了村子的黑暗，团藏获得以暗部培训部的名义成立了隶属于自己的独立组织“根”的权利。
在《疾风传·卡卡西暗部篇》中，“根”成员曾奉团藏之命，组建十人队伍执行对在九尾之乱结束后重新上任的三代 目火影实行暗杀，但由于曾被拉拢的旗木卡卡西的倒戈而失败。
在宇智波灭族事件之后，猿飞日斩下令解除团藏“火影辅佐”的职务，并让团藏将“根”解散。
虽然“根”在宇智波灭族事件后就已经解散，但仍有不少成员继续在暗部任职，甚至继续效忠于“根”。若干年后，该组织因得到了木叶两大顾问水户门炎和转寝小春的支持而重新恢复建立。
在《BORUTO -火影新世代-》中笕堇透露，第四次忍界大战结束后，“根”在木叶众人的反对声中正式退出了历史舞台，但仍旧有残党四处活动。
《阵之书》原文记载，根的队员是由团藏直接招募组成，团藏选择的对象是具有特殊能力的人，以及心中有黑暗的人等等...... 根
队员需要接受“消灭自我“的训练，为了守密，也会对他们施加咒印，团藏彻底将他们培养成完全执行任务的棋子。[1] 所谓“根”之人，没有名字、亦无感情。没有过去，无未来。心中只有任务，在背后支撑起木叶村这棵大树的是 深扎于大地之中的……“根”的意志。
“根”成员佩戴的面具比火影直属暗部的面具要更加丰富多彩，并不只限于仿照动物的面部。
根
暗杀分队