1898年3月14日，中学生马克斯·施瓦布（Max Schwab）、赫尔曼·鲍尔（Hermann Bauer）、弗朗茨·凯尔利（Franz Kehrli）和奥斯卡·施瓦布（Oskar Schwab）共同创立了伯尔尼年轻人足球俱乐部（FC Young Boys），队服颜色采用黄黑相间的配色。[20]
1898年6月17日，伯尔尼青年人队迎来队史首场比赛，对阵维多利亚FC并最终战胜对手。起初，伯尔尼青年人队作为伯尔尼足球俱乐部（FC Bern）的学生队参赛。然而，随着越来越多的伯尔尼青年人队球员进入伯尔尼一线队，原有的伯尔尼球员感到压力，认为他们的球队会员权益受到威胁。伯尔尼年轻人队面临选择：要么彻底并入伯尔尼足球俱乐部，要么退出该俱乐部独立发展。最终合并提议以压倒性多数被否决。[20]
1900年，伯尔尼年轻人队被瑞士足球协会接纳。1900-01赛季，伯尔尼年轻人队首次参加瑞士顶级联赛乙级组并升入甲级组。1903年，伯尔尼年轻人队首次问鼎瑞士足球顶级联赛冠军，随后在球队1909、1910和1911年实现三连冠。[20]
20世纪50年代，伯尔尼年轻人队迎来黄金时期。在德国教练阿尔伯特·辛格（Albert Sing）的带领下，伯尔尼年轻人队在1956-57赛季至1969-60赛季实现瑞士顶级联赛四连冠，并在1953和1958年两度捧起瑞士杯。1959年，伯尔尼年轻人队更是打入欧洲俱乐部冠军杯半决赛，但最终两回合总比分1-3不敌法国球队兰斯足球俱乐部，无缘决赛。[20]