1992年12月与国家重点工程合肥铁路新客站同步开工建设。 合肥火车站
1995年4月,安徽省政府正式批准设立试验区。
1996年2月,国家建设部将试验区列为全国首家城市综合开发试点区。试验区系省级开发区,享有市级经济管理权限,原规划面积为10平方千米。
1999年8月,市政府批准将原郊区的瑶海街道划归试验区代管。
2001年5月24日,原瑶海街道的长淮、方庙、汪塘、胜利4个社居委调整为长淮、方庙、汪塘、胜利、临泉中路、火车站广场6个社居委。
2001年9月24日,合肥市人民政府同意把原瑶海街道划分为方庙、瑶海两个街道办事处。
长淮街道办事处下辖胜利、长淮两个社居委;方庙街道办事处下辖汪塘、方庙两个社居委。
2001年11月27日,瑶海街道临泉中路、火车站广场社居委范围进行了调整。
2003年3月,瑶海区七里塘镇(现为七里塘街道)划归新站试验区代管,辖区面积增至34平方公里。2004年1月,管委会通过方庙街道社居委设置方案,并同意增设安徽大市场社居委、万绿园社居委,方庙社居委更名为瑶东社居委。
2005年3月31日下午,试验区管委会与瑶海区政府签订了三角线、红星社居委移交协议,从2005年4月1日起瑶海区车站街道的三角线和红星两个社居委移交试验区管理。
试验区长淮街道长淮社居委的赵仓坊居民组原则上在2005年年底移交给瑶海区车站街道管理。
2005年6月1日,经省政府同意,省民政厅批复,撤销七里塘镇设立七里塘街道办事处。