由于受到体积上的限制，笔记本电脑的主要输入设备鼠标和键盘都与台式机有一些区别。 目前笔记本电脑内置的常见鼠标设备（确切地说应是指点设备）有四种，它们分别是轨迹球、触摸屏、触摸板和指点杆，其外观都与标准鼠标大相径庭，但功能是一致的。
轨迹球的特点是体积较大，比较重，容易磨损和进灰尘，且定位精度的能力一般，现在轨迹球已经被淘汰了。
触摸屏使用起来最方便，但定位精度较差，制造成本也最高，目前多用于超便携笔记本电脑之中，在全内置和超轻超薄笔记本电脑上比较少见。
触摸板是目前使用得最为广泛的笔记本电脑鼠标，Compaq、Dell等品牌的笔记本电脑均配有触摸板。触摸板由一块能够感应手指运行轨迹的压感板和两个按钮组成，两个按钮相当于标准鼠标的左右键。触摸板的是没有机械磨损，控制精度也不错，最重要的是，它操作起来很方便，初学者很容易上手，一些笔记本电脑甚至把触模板的功能扩展为手写板，可用于手写汉字输入。不过，缺点是使用者的手指潮湿或者脏污的话，控制起来就不那么顺手了。
指点杆（Track Point）是由IBM发明的，目前常见于IBM和Toshiba的笔记本电脑中，它有一个小按钮位于键盘的G、B、H三键之间，在空白键下方还有两个大按钮，其中小按钮能够感应手指推力的大小和方向，并由此来控制鼠标的移动轨迹，而大按钮相当于标准鼠标的左右键。指点杆的特点是移动速度快，定位精确，但控制起来却有点困难，初学者不容易上手，但不少用户在掌握了指点杆的使用诀窍后，往往对它爱不释手。缺点是用久了按钮外套易磨损脱落，需要更换。