稻瘟病原菌属于半知菌类丛梗孢科、梨形孢属[1] 。稻瘟病病原菌无性阶段（自然条件下）为灰梨孢菌（学名：Pyricularia oryzae Cav.），属半知菌类梨形孢属；有性阶段（在人工培养基上经用不同菌株交配后形成的有性世代）为灰色大角间座壳菌（学名：Magnaporthe grisea Barr. ），属子囊菌广大角间座壳属[4] 。
菌丝：无色透明，丝状，有隔膜[1] 。 稻瘟病原菌
分生孢子梗：3-5根丛生成束，有时多达10根，从气孔或病部表皮伸出，线状不分支，大小为112（-456）微米×3（-4）微米，有2-8隔膜，基部稍膨大，略带褐色，越至上部色越淡，其顶端可产生分生孢子5-6个，多的达9-20余个，顶端屈曲处有分生孢子脱落的痕迹[1] 。
分生孢子：无色透明，鸭梨形或慈姑形。成熟孢子通常有2个隔膜，顶端尖，基部钝圆，有小突起，大小为17（-33）微米×6.5（-11）微米，萌发时两端细胞产生芽管，芽管的顶端，产生附者胞，呈球形或椭圆形，深褐色，壁厚，直径8-12微米，能紧紧贴附于寄主体上，产生侵入丝，入侵寄主组织。病菌分生孢子的大小常因不同菌株和培养条件而有一定的差异[1] 。
稻瘟病原菌菌丝发育的温度范围为8-37℃，以26-28℃为最适宜。分生孢子在10-35℃之间都可形成，以25-28℃为最适宜。孢子萌发和附着胞形成的温度要求与孢子形成相同。病菌湿热处理，分生孢子经52℃处理5-7分钟、谷颖内的菌丝体经55℃处理5分钟、病节内的菌丝体经55℃处理10分钟即死亡，但对干热的抵抗力均较强，分生孢子和菌丝体经100℃处理60分钟仍能大部存活。分生孢子在干燥状态下对低温的抵抗力也较强，在-10℃时经75天还有10-30%的孢子可以萌发，在 中国北方寒冷地区可以越冬[1] 。
分生孢子的形成以空气湿度达饱和时最好，相对湿度低于90%，孢子形成量就减少到1/10左右，相对湿度在80%以下几乎不能形成。孢子须有水滴存在且相对湿度达96%以上时，才能萌发良好。当空气湿度饱和而无水滴时，萌发率就减少到1%以下，相对湿度低于90%，则不能萌发。病菌侵入过程中所需保湿时间与温度有关，26℃需6小时，28℃需8小时，32℃需10小时，34℃则不能侵入[1] 。