黑穗病由担子菌亚门黑粉菌属（Tilletia）真菌引起，菌丝体在寄主组织内扩展，形成具网状突起的厚垣孢子。小麦矮腥黑穗病菌（TCK）孢子直径18-24μm，表面具网纹状突起，与近似种可通过ISSR引物进行分子鉴定。孢子萌发需持续低温（3-8℃）及75天以上高湿条件，致病力可保持3年[1] [3] 。
病穗短直，颖壳外张呈"鱼嘴状"，籽粒内部被黑色孢子替代，挤压破碎后释放鱼腥味三甲胺气体。TCK属我国进境检疫性病害，1972年因输入疫区小麦导致检疫标准升级[1] 。
病穗提前7-10天抽出，初期包裹半透明灰色薄膜，成熟后薄膜破裂散出黑粉，仅剩裸露出穗轴。带菌种子是主要传播源，抽穗期遇阴雨天气会加剧扩散[3] 。
远距离传播依赖带菌种子调运，加拿大曾因输出疫区小麦导致国际检疫纠纷。田间传播通过耕作机械携带含菌土壤，以及施用未腐熟粪肥实现二次扩散[1] [2] 。病麦洗麦水灌溉可使孢子污染面积扩大200倍[2] 。
染病植株分蘖数增加1-2倍，株高降低至健康植株的1/3-1/2，千粒重下降60%以上。病麦加工面粉含三甲胺毒素，浓度超过0.02%时可引发人畜呕吐、腹泻等中毒症状[1] [2] 。根据1999年中美农业协议规定，小麦样本中TCK孢子量超过3万个/50g即判定为疫麦[1] 。
检疫措施口岸采用X光机筛查结合孢子离心富集法检测，对疫麦实施130℃蒸汽处理或溴甲烷熏蒸[1]。
农业防治重病田实行5年以上轮作，播种深度不超过5cm以避免延长出苗期。西北春麦区推行适期晚播，将出苗期调整至日均温超过10℃的环境[2][3]。
化学防治种子处理采用戊唑醇（2%干拌种剂30g/100kg种子）或三唑酮（15%可湿粉200g/100kg种子）拌种，土壤消毒使用50%多菌灵3kg/亩配制成毒土撒施[2][3]。
生物防治应用哈茨木霉T-22菌株拌种，通过竞争作用抑制孢子萌发，防效可达65%-78%[2]。
该病害防控需遵循"阻断传播源、切断侵染链、保护易感期"三位一体策略，特别在抽穗扬花期加强田间监测，及时拔除中心病株并用塑料袋封闭处理[2] [3] 。