2005年11月6日，Super Junior正式出道，于韩国SBS电视台音乐节目《人气歌谣》首次登台表演出道曲《Twins (Knock Out)》[1] ；11月11日，发行单曲《You Are The One》[27] ；12月5日，发行首张韩语正规专辑《SuperJunior 05》[2] ；12月12日，专属综艺节目《Super Junior Show》首播[27] ；12月16日，Super Junior与东方神起合作发行了圣诞合集单曲《Show Me Your Love》[28] 。
2006年5月27日，曺圭贤加入Super Junior[3] ；5月，专属综艺节目《Super Junior Full House》及《美少年宿舍大骚动》首播[29] ；6月2日，Super Junior官方歌迷会E.L.F（Ever Lasting Friends）的名称公开发表[30] ；6月17日，发行单曲《U》[31] ；6月25日，Super Junior凭借单曲《U》首次获得韩国SBS电视台音乐节目《人气歌谣》冠军，随后《U》连续3周获得该音乐节目第一位[32] [33] ；8月21日，KBS电台节目《Super Junior Kiss The Radio》开播，由利特、银赫担任DJ[34] ；11月5日，Super Junior第一个子组合Super Junior-K.R.Y.在韩国出道，由艺声、厉旭和圭贤组成[35] ；年底，在金唱片大赏、首尔歌谣大赏、MKMF及SBS歌谣大战中获得新人赏[36] [37] [38] [39] 。
2007年2月23日，Super Junior第二个限定子组合Super Junior-T成立，由利特、希澈、强仁、神童、晟敏以及银赫组成，成为偶像中首个挑战民谣的组合，并发行单曲《来过倒》[40] ；7月26日，Super Junior全体成员主演的青春喜剧电影《花美男连锁恐怖事件》在韩国首映[41] ；9月20日，发行第二张韩语正规专辑《Don't Don》[4] ；11月5日，发行第二张韩语再版专辑《Don't Don》，并收录了浪漫抒情歌《Marry U》等十七首作品[42] ；11月27日，Super Junior全体成员参与的综艺节目《人体探险队》首播[43] ；11月7日，在MKMF颁奖盛典中获得年度歌手大奖、网民选择奖和手机人气奖三个奖项[5] 。