历史系是我校传统优势院系之一。目前设有中国古代史、中国近现代史、中国民族史和世界史4个教研室，中国经济史研究所、考古学与文物评估中心、亚非研究中心等科研机构。历史学专业为国家文科基础学科人才培养和科学研究基地（1995年）、一级学科博士点授予单位（2003年），专门史（中国经济史、中国民族史、中国与周边国家关系研究、中国西南边疆问题研究）为全国高等学校重点学科（2007），中国民族史、中国经济史为云南省高等学校重点学科。
历史系为全国首批批准的博士硕士学位授权点的单位，目前共有10个博士学位授权点和10个硕士学位授权点,1个专业硕士授权点。
整合校内外历史学资源，目前有在职教职工60人，其中教授32人，历史学专业现有博士生导师（含校外）17人。
历史系资料室藏书5万余册，中外文期刊200余种，机房拥有计算机20余台，多媒体教室设备先进、齐全。近五年来，承担省部级以上科研项目20 余项，出版学术著作、教材近百部，发表论文300 余篇。