宋大观元年（1107年），始置邛水县，属思州。宣和四年（1122年），废为堡。绍兴二年（1132年），复设邛水县，属思州安抚司。
元至元十六年（1279年），改邛水县为安定县。至元二十年（1283年），复名邛水县，另置晓隘、泸洞、赤溪等7处长官司。
明洪武五年（1372年），废泸洞、赤溪等长官司，分置团罗、得民、晓隘、坡带、邛水五长官司，属思州宣慰司。洪武二十年（1387年），并四司，设邛水一十五洞蛮夷长官司，司治荡洞（今长吉乡司前村），邛水司编户二里，上里十一洞，下里十洞，还有“边方七十二寨”，包括今三穗县境大部分地区。永乐十二年（1414年）三月，将邛水司改属镇远府。正统九年（1444年），邛水司置颇洞等16堡。天顺元年（1457年），邛水司复置颇洞、岑娄、八弓、得民4堡。万历三十年（1602年），梁（良）上、巴野（冶）归属镇远府。清雍正十二年（1734年），置邛水县丞，属镇远县。
民国二年（1913年）8月，将邛水属之桂丹、圭仲划给剑河，将青溪县的南屯，镇远县的响水，剑河县的台烈、顺安（今顺洞），思县城（即岑巩）的大小河（即今桐林镇大部分地区）等地拨归邛水，在原邛水县丞基础上设置邛水县，属黔东（镇远）道。十二年（1923年），邛水县直属贵州省公署。十五年（1926年）6月，邛水县易名灵山县。十七年（1928年）4月，因上年“秋收丰稔，一禾三穗”，灵山县改名三穗县。二十四年（1935年）三穗县属镇远专署。 三穗县 位置图
1949年11月7日，三穗解放，由铜仁地委派员接管。12月下旬，正式明确三穗县属镇远专署；
1956年7月，三穗县属黔东南苗族侗族自治州。
1959年1月，三穗、岑巩并入镇远县。 共2张 三穗县
1962年6月1日，恢复三穗县建置，仍属黔东南苗族侗族自治州。[5]
民国二十八年（1939年）2月，将剑河县属南京堡划归三穗县报京管辖。三十年（1941年）12月，报京、冽洞拨归镇远县。