大兴安岭的鄂温克族是中国唯一的一个饲养驯鹿的部族。柳芭是为数不多走出山林的鄂温克人，考取了中央民族大学学习美术的她一直是家族的荣耀。有一天，柳芭回到了山林，此时的鄂温克人正处于从游牧走向定居的变迁之中，和家传的神鹿在一起，柳芭感到了一些安静，但在森林里，她已经显得与众不同。终于，柳芭离家出走，4天走了300公里，嫁给一个林场的老工人，他很爱她，而她只是感激。柳芭依然割舍不下山里的驯鹿和生活，于是她就在定居点和部落之间迁徙，随着驯鹿出生、死亡，柳芭也有了自己的女儿[3] 。 共6张 剧照
孙曾田最初拿到《神鹿啊，我们的神鹿》这个选题的时候，他边采访拍摄对象，边思考这个纪录片的价值。当确定了“人类文化的多样性的消失”这个主题后，孙曾田便全身心投入到该片的拍摄中。在该片拍摄的过程中，孙曾田坚持追求“真实”，他不允许“傻拍”的存在。因为该片全程是使用胶片摄影机拍摄的，所以孙曾田在开机的时候格外珍惜。最终剪辑完成的成片与拍摄素材的片比达20：1[4] 。
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孙曾田虽然用“神鹿”来为这部纪录片命名，但神鹿并不是该片关注的最终重点。它在全片中最重要的情节是它 的死去以及它死去时姥姥的反应。它只是作为一个背景被交待，仅仅是作为“故事”发生的基础来介绍的。神鹿展现了鄂温克民族的部分民族文化，但是所展示的这些在全片里，与讲述柳芭的故事和感受比较起来就显得远没有那 么厚重了。《神鹿啊，我们的神鹿》的关怀主体仍然是“人”。柳芭是该片关注的焦点， 鄂温克族这一家三代女人唯有柳芭才是孙曾田所说的“片中人”。该片的主要感情是通过柳芭的命运、生活体验来表达的。《神鹿啊，我们的神鹿》全片所关注的痛苦是柳芭的痛苦[2] 。（张继懿、王珺、徐晓村评）