星星球的人们发现了一个新星球：古灵星，它是一颗神秘的星球，上面蕴含着各种神秘的资源。为了寻找那里面的一种极具危险性的放射性元素，超人们在李门和电视机校长的带领下前往神秘而原始的古灵星探险；大小怪则为了寻找传说中守护古灵星的三个超人，同时寻找能侵略星星球的能源石，悄悄搭上超人们的飞船，“偷渡”到古灵星。
超人们在探险中发现了很多神奇好玩的事情，而大小怪的破坏行动又让探险生活充满了危险。然而在无意中发生的一系列事件让探险队员们产生了怀疑——古灵星真的像看上去的那样原始吗？《开心宝贝之古灵星历险记》为《开心宝贝》系列第六部，整部动画延续了前几部的诙谐幽默。