位于新界西贡区西南部。将军澳的沿岸亦称为将军澳，位于九龙半岛以东。西部为调景岭，西南部为鲤鱼门，东部则为向东南伸延的清水湾半岛。整个将军澳新市镇行政上为西贡区管辖，大部份的土地都是从填海得来，除了近山及较早开发的土地以外，其他地方大多数都是靠填海得来。
将军澳新市镇可分为八个区域，包括翠林、宝琳、坑口、将军澳市中心、调景岭、小赤沙、大赤沙及百胜角。新市镇当中最早开发的是翠林一带，其次到宝琳及其南部的景林邨一带。1990年代中期，待坑口一带的原居民迁走之后，政府在当地兴建厚德邨，并用来安置原来在调景岭的居民及牛头角临屋区的住户。将军澳市中心一带的尚德邨、唐明苑等在1990年代后期才开始入伙，并开始发现新填海区的不平均沉降问题。调景岭在所有居民迁出之后全数拆卸，并进行移山填海工程，是现时将军澳最新发展的区域。此外，该区尚有将军澳南的填海区（宝盈花园对出空地）及百胜角一带尚未发展。现时将军澳的发展主要是房屋及社区设施。 将军澳新市镇
宝林、翠林、坑口、康城、将军澳市中心、调景岭基本上皆属住宅区，有公屋、居屋和私人屋苑。在屋苑基层通常皆设有商场，方便区内人士购物。
小赤沙现时设有港铁将军澳车厂及康城站。
大赤沙北部，则设有将军澳工业邨。
由于有很多市民误把将军澳视为九龙区，地域上将军澳新市镇与所属区分西贡市中心距离较远，反而却靠近东九龙的观塘区。加上此市镇在开发典故并没有明确的区域定义，而地方行政社区工作及居民起居又多以东九龙为补给点，例如警务处及消防处便属东九龙总区等，加上各大商业机构等传媒均错误喧染所致，以为占尽地利等因素，较显著的例子如某大电子传媒常在屏幕上标示自己地址为九龙清水湾道将军澳电视城；另于2009年，位于新界将军澳宝琳的大型商场新都城在宣传板上以“东九龙最大购物中心”自居，由于宝琳实际上是位于新界东西贡区，因此遭到真正位于东九龙区最大的购物商场——位于九龙湾的MegaBox去信表示不满，并保留诉讼权利。后来新都城删去有关字眼，事件才不了了之。
虽然如此，亦有市民误把位于宝琳路和秀茂坪道交界的宝达邨与宝林邨混淆，以为同属将军澳范围的屋邨，其实位于上述地方宝达邨才是真正属于九龙的观塘区。
1982年香港政府正式落实发展将军澳为第三代新市镇，发展计划分三期进行。简略来说，第一期发展于 1983 年开始，涉及范围包括了三个住宅区：翠林、宝林和坑口，以及两个工业发展区域：小赤沙和大赤沙。
翠林内主要有翠林邨和康盛花园。翠林邨于 1988 年落成入伙，是将军澳最早建成的公共屋邨之一，同时是将军澳新市镇内唯一并非在填海区发展出来的公共屋邨。