生殖器官，准确的说，是指在复杂生物体上任何与有性繁殖及组成生殖系统有关的组织（严格意义上，不一定都属于器官）。
人类及大部分哺乳动物的生殖器官主要有：
男性（雄性）：阴茎、睾丸、附睾、阴囊、前列腺、精液、尿道球腺、精囊等。
女性（雌性）：阴蒂、阴道、阴唇、子宫、输卵管、卵巢、前庭小腺、前庭大腺等。
生殖腺是指产生配子的器官。在人类身上是指睾丸与卵巢。
孢子植物孢子体的雌性生殖器官为颈卵器，雄性生殖器官为精子器。种子植物的花、果实或种子。雄性生殖器官为雄蕊，雌性生殖器官为雌蕊。但植物的繁殖不一定依赖这些器官或组织。
苔藓和蕨类植物的配子体有雄性生殖器官，即精子器，雌性生殖器官——颈卵器；苔藓孢子体的生殖器官是孢子囊，即孢蒴；蕨类孢子体的生殖器官是孢子囊，其见于枝顶的孢子囊穗或孢子叶背面。[3]
裸子植物的雌配子体的生殖器官，大多数为颈卵器；买麻藤目的雌配子体的生殖器官退化为一些游离核，百岁兰目雌配子体生殖器官发育成胚囊管之类的结构。裸子植物的雄配子体（花粉、花粉管）的生殖器官高度退化，其精子器退化为管细胞和生殖细胞，生殖细胞后来分裂为二精子。裸子植物孢子体的生殖器官是大、小孢子囊，它们分别是大孢子叶上胚珠的珠心和小孢子叶背面的小孢子囊。[3]
花是被子植物与生殖密切相关的器官。严格说来，雌蕊中的胚珠之珠心是大孢子囊，雄蕊的药囊是小孢子囊，大、小孢子囊是孢子体的生殖器官。被子植物的配子体中，雌配子体的卵器（2个助细胞和1个卵细胞）是其雌性生殖器官，由颈卵器退化而成；花粉粒、花粉管中的1个营养细胞和2个精子构成一个雄性生殖单位，即为雄性生殖器官。[3]
男性生殖系统由内生殖器和外生殖器两个部分组成。外生殖器包括阴囊和阴茎；内生殖器包括生殖腺体（睾丸）、排精管道（附睾、输精管、射精管和尿道）以及附属腺体（精囊腺、前列腺和尿道球腺）。男性的生殖系统与泌尿系统有部分合并，如：阴茎和其中的尿道（也称输精管）。
男性生殖系统
女性生殖系统由内生殖器和外生殖器两个部分组成。外生殖器指生殖器官的外露部分，又称外阴。包括阴阜、大阴唇、小阴唇、阴蒂、前庭、前庭大腺、前庭球、尿道口、阴道口和处女膜。内生殖器包括阴道、子宫、输卵管及卵巢。阴道是经血排出和胎儿自母体娩出的通道，又是性交器官。
1.外生殖器 女性外生殖器