各种原因导致的慢性肝病均可以发展至肝硬化，其中在中国以乙型肝炎病毒感染为主。
肝硬化病因大致可分为病毒性肝炎、慢性酒精性肝病、非酒精性脂肪性肝病、长期胆汁淤积、药物或毒物、肝脏血液循环障碍、遗传和代谢性疾病、免疫紊乱、寄生虫感染等。
病毒性肝炎
乙型、丙型、丁型及少数戊型肝炎均可以进展为肝硬化，但在中国以乙型肝炎为主，大约占一半以上。
由肝炎进展为肝硬化的主要原因有三种：持续存在的肝炎病毒、中重度肝脏坏死、纤维化。若有不同类型肝炎的重叠感染可加速肝硬化的进展。
酒精性肝病
慢性酒精中毒为欧美国家肝硬化最常见的原因，大约占比50%~90%，但在中国相对少见，仅有10%左右。
非酒精性脂肪性肝病
是仅次于病毒性肝炎和慢性酒精性肝病的最常见的病因，且有增加趋势。
长期胆汁淤积
分原发性和继发的胆汁性肝硬化，后者多由各种原因引起的胆道梗阻所致。高浓度胆酸和胆红素的毒性作用可加速肝细胞变性，从而进展为肝硬化。
药物或毒物
长期服用某些药物（如抗叶酸类抗肿瘤药、异烟肼等）、反复接触某些化学毒物（如砷、四氯化碳等）均可引起相关肝炎，最后进展为肝硬化。
肝脏血液循环障碍
各种病因引起的肝内长期淤血及缺氧，使其相应区域肝细胞坏死、纤维化，进而进展为肝硬化。
遗传和代谢性疾病
由于遗传和代谢等相关因素引起的肝硬化。
中国以肝豆状核变性（Wilson病）最为多见，该病以铜代谢障碍为主。在西方国家，以血色病（铁代谢障碍引起）和α1-抗胰蛋白酶缺乏症（α1-AT缺乏症）为主。
此外，酪氨酸代谢紊乱所致的酪氨酸血症也可引起肝硬化。