独立报于1986年由原《每日电讯报》的三个记者创办。第一周发行量高达50万份，一个月后稳定在33万份。80年代后期由于创办人不和、资金不足，报纸困难重重。
1994年起镜报集团和爱尔兰独立新闻和媒介集团（Independent News &Media PLC）联合控股《独立报》，1998年后，后者成为《独立报》的唯一老板。
2003年9月《独立报》在英国大报中率先推出全盘化的小报版本。大获成功，从2004年5月开始彻底转型为小报，至2007年8月为止的发行量为240,116份，
该报自称在政治上独立。惠特姆·史密斯亲自出任该报主编。
2010年，俄罗斯商人列别杰夫收购了《独立报》的母公司ESI媒体集团。列别杰夫表示，过去30年来，新闻业发生了翻天覆地的变化，因此报纸也需要做出改变。停止发行纸质版《独立报》，是为了迎接数字化媒体时代的到来。他表示，虽然停止印刷纸质版，但ESI媒体集团将保留独立报的品牌，并会继续投资高品质的内容，吸引更多读者关注独立报的网络平台。
2016年3月26日，《独立报》出版最后一期报纸，宣告该报的纸质版正式停刊，此后将转变为一家网络媒体。
最后一期《独立报》纸质版的头版，除了报头和右上角的条形码外全面留白，中央印着鲜红粗体字“纸版停刊”，下方小字写着，“请阅读本报的最后一期印刷版以及四个版的纪念特刊，1986-2016”。
《独立报》纸质版的最后一篇社论写道，“印刷机已停，墨水已干，报纸将不再发皱……但一个章节终止后，另一个章节会开启，独立报的精神将长存。”[1]