1791年12月12日，[1] 奥地利的玛丽·路易丝女大公（拉丁语洗礼名：Maria Ludovica Leopoldina Francisca Theresa Josepha Lucia[1] ）在维也纳的霍夫堡皇宫内出生。[1] 她是奥地利的弗朗茨大公（后来的神圣罗马帝国皇帝弗朗茨二世）和他的第二任妻子，那不勒斯和西西里的玛丽亚·特蕾莎公主的第一个孩子。[1] 从她的父辈来看，玛丽·路易丝是神圣罗马帝国女皇玛丽娅·特蕾莎的曾孙女，法国王后玛丽·安托瓦内特的侄孙女。[1] 她还是玛丽·安托瓦内特最喜爱的姐姐，那不勒斯和西西里王后玛丽亚·卡罗利娜的外孙女。[1]
玛丽·路易丝的性格形成的时期正值法国与她的家人爆发冲突之际。[1] 她从小便在厌恶法国和法国思想的氛围中长大。[1] 玛丽·路易丝也受到了她的外祖母玛丽亚·卡罗利娜鄙视造成其妹妹玛丽·安托瓦内特死亡的法国大革命的思想的影响。玛丽亚·卡罗利娜的那不勒斯王国也与拿破仑·波拿巴率领的法国军队爆发的正面冲突。[1] 而且，第三次反法同盟将奥地利推向了毁灭的边缘，此事也加深了玛丽·路易丝对拿破仑的怨恨。[1] 1805年，[1] 皇室成员被迫逃离维也纳，玛丽·路易丝随即前往匈牙利避难，之后又前往加利西亚，直到1806年才返回维也纳。[1] 她的父亲放弃了神圣罗马帝国皇帝的头衔，但依旧保留奥地利皇帝的称号。[1]
为了让她能够成为最适合的结婚对象，她的父母让她接受了多种语言的教育。[1] 除了她的母语德语以外，她还能说一口流利的英语、法语、意大利语、拉丁语和西班牙语。[1]
1807年，[1] 当她15岁时，[1] 她的母亲因早产去世。[1] 不到一年后，玛丽·路易丝的父亲弗朗茨二世便娶了比玛丽·路易丝只大4岁的皇帝的第一代表妹，奥地利-埃斯特的玛丽亚·卢多维卡·贝娅特丽克丝女大公。[1] 尽管如此，玛丽亚·卢德维卡也对她的继女扮演了一个母亲的角色。[1] 她也对法国怀恨在心，因为法国侵占了她父亲的摩德纳公国。[1]
1809年，[1] 法国和奥地利再度爆发战争，奥地利也再度失利。[1] 皇室成员也不得不在维也纳于5月12日投降前再度逃离。[1] 皇室成员在逃离的途中遭到了恶劣的天气，当他们抵达布达时早已全身湿透筋疲力竭。[1]
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