政治学系将招收政治学专业的博士研究生和硕士研究生，并招收转型政治学方向和政治学量化分析方面的博士后研究人员。本科生培养采取清华大学新的培养模式，即本科生一、二年级不分专业，通识教育，三年级起进入专业培养阶段。
1911年开办的清华学堂，在史学政治类的名目下设立了政治学的课程。1915年，唐悦良任教清华，开创了以华人专业教师讲授政治学课程的先河。1920年11月，清华高等科同学创立了清华政治学会，1926年4月，清华正式改制为大学，设立专修课程政治系。1928年清华又改制为国立大学， 1936年，清华政治学系在国内创办研究生教育，
1937年清华南迁，与北京大学和南开大学共同组成了西南联合大学， 1947年清华复员回到北京，1951年清华大学院系改革调整，计划将政治学系的教学组升级为独立学系，但在1952年的全国院校调整后，清华大学成为一所多科性的工业大学， 1978年清华大学逐步恢复了理科和文科建制。2000年5月，政治学系复建，李润海教授担任系主任；2009年8月，政治学系全面重组，张小劲和景跃进教授分别担任系主任和副主任，
政治学系下设有办公室和若干涉及专门问题的教授委员会，包括：学术委员会，招聘委员会，
本科生委员会，研究生委员会，资源委员会。
在政治学系框架下的学术研究机构有：民主与治理研究中心、中国政治发展研究中心和比较地区一体化研究中心。[1]