转基因技术是一项新型生物技术，具有很多传统花卉育种所不具备的独特优势，比如可以通过转入基因而扩大整个花卉的基因库，因而就可人工创造出一个更大更新的花卉宝库，还可以只定向修饰改变一些你不喜欢的花卉性状而保留那些你喜欢的优良品质；利用转基因技术将外来性状转入到现有花卉中，形成一个新的品种，就叫“转基因花”。
为了改良花卉的颜色、香味、形状和保鲜期等多方面的性状，科学家们的思路是首先要了解这些性状的生理机制，进而找到并克隆出与之直接或间接相关的各种基因，深入研究这些基因后，再修饰并转入到需要改良品质的花卉中，从而定向创造出花卉新品种.转基因的花其实是一种或几种植物的结合体，科学家研究出来的转基因技术创造了它。
在花卉的颜色改良方面，科学家们已经克隆到了多个与颜色相关的花卉基因。比如：科学家已经利用转基因的技术在矮牵牛花中，已经克隆到了两个能使花趋向于显蓝色的基因，转基因技术也可以使人们培育出珍稀的蓝色月季和康乃馨。另外，科学家们利用转基因技术，已经在矮牵牛、菊花等观赏花卉中成功地进行了花色修饰。比如法国分子生物学家将几个不同花色的基因分别导入开红花的矮牵牛中，结果得到了开粉红色和白色花的矮牵牛，甚至还得到了白色花中有一小抹红色或红色花中有一小抹白色的奇特矮牵牛。
在花卉的香味、形状、大小、质地等品质性状研究方面，由于涉及的物质极其多样，代谢途径也非常复杂，所以研究起来很困难。但是也取得了一些令人振奋的突破性进展。比如生物学家皮斯用发根农杆菌转化柠檬天竺葵，发现转化植株中芳香族物质有显著提高，花朵散发出迷人的甜香味，植株矮化，枝叶更繁茂。1996年底，华裔科学家罗达与其合作者一起利用克隆技术克隆到了一种控制花朵形状的基因，并发现这种基因和另一种基因在一起会对花朵形状的形成起关键作用。此类基因发挥作用时，金鱼草的花就发育成不规则形；发生变异时金鱼草的花就发育成规则形。这一研究对揭示基因如何控制花的形状提供了可参考的信息，同时还是用来培育形状独特的珍奇花卉参照资料。 新奇的转基因花（花苞）
人们一直梦想着可以得到开不败的鲜花，因而如何延长花卉的保鲜期一直是科学家们研究的热门课题。花卉保鲜主要是加入保鲜剂，或者用低温冷藏、气调贮运等方法，但是这些方法不仅效果不好，而且保鲜剂基本上都有毒性，温控、气调的设备等成本又太高。所以有关花卉衰亡基因及基因工程的研究就十分活跃，其中研究得比较成功的例子是围绕乙烯与花卉衰老的关系而进行的研究。乙烯是内源衰老激素，各种花卉对乙烯都有一定程度的敏感性，有很多商品价值较高的观赏花卉对乙烯非常敏感，如康乃馨、满天星、百合花、卡特兰等等，甚至极少量的乙烯也会使这些敏感花卉枯萎凋零。现如今已经先后克隆到了一些与乙烯合成相关的基因，并且已经有多个实验室报道获得了转基因的抗衰老花卉。特别令人振奋的是，1995年澳大利亚花卉基因公司生产的各种的鲜花，因为可长久保存在澳大利亚被获准上市，成为世界上第一个获准上市的转基因花卉。
由于花卉的价值主要在于它的观赏价值，所以转基因花卉的商业化应用和推广不会像转基因的粮食作物、果实植物等那么困难。估计在一些发达国家转基因花卉可实现商业化。 完全可以设想在未来的某一天，我们只需打一个电话给花卉公司，描绘一下心中想要的花卉图像，工作人员就可以从转基因花卉库里找到你要的那种特别的花卉。这将促进花卉业的技术，加快花卉业的经济发展。
转基因的绿色植物通常都没有非转基因的健康。转基因的技术还在不断的发展中，还不够成熟，因为改变植物本身的基因情况，所以转基因的产品就没有原本在自然规律下催生出来的植物健康，对人体还是会有一定的影响，建议人们还是少吃转基因的东西为好，减少对人体（尤其是孕妇和还在发育中的小朋友）产生的不良影响。但是，转基因食品至今尚未发现有对人身体等危害的实例，一般来说还是可靠的。转基因生物的管理与认证技术还未成熟。
为推动我国花卉业快速发展，中央和地方相继出台了一批扶持花卉生产的政策。从当前形势看，中国花卉业实现跨越式发展的条件已经基本成熟：
1)国民经济的持续快速发展和城乡居民可支配收入的增加，将会有力地拉动花卉消费市场；
2)不少地方在农业产业结构调整中已经将花卉业作为重要产业进行了科学规划；
3)我国加入WTO后，花卉业的国际合作与交流将更加广泛，有利于提高我国花卉生产的整体技术水平和市场竞争能力。