1843年法国化学家Antoine Jerome Balard发现了次氯酸，方法是向一瓶氯气中添加氧化汞在水中的稀悬浮液。他还命名了次氯酸及次氯酸盐。在第一次世界大战期间使用次氯酸盐溶液作为创伤伤口的抗菌剂之前，次氯酸的抗感染能力已经为人所知[4] 。
1940年伦敦的医院就开始使用含有次氯酸的雾化溶液来预防散布在空气中的病原体。
1948年美国哥伦比亚大学医学系Knox等人首次提出次氯酸是一种巯基抑制剂，抑制葡萄糖氧化是氯溶液杀菌性质的主要因素。
1976年美国生物学家Harrison， J. E.发现HOCl是在活化的人类嗜中性粒细胞和其他组织驻留吞噬细胞中自然形成的，并证明次氯酸有着明显的杀菌作用[5] 。
1988年南加州大学毒理学研究所McKenna和Davies提出次氯酸使细菌失活是抑制DNA复制的结果。当细菌暴露于次氯酸时，DNA合成会急剧下降。
2002年日本将次氯酸水这种安全环保的杀菌剂指定为食品添加剂引入食品行业。
2006年英国牛津大学约翰·拉德克利夫医院公共卫生实验室Selkon， JB等人实验得出使用次氯酸作为顽固性静脉曲张性溃疡的辅助治疗可明显促进愈合并迅速缓解疼痛。
2007年美国医学教授Robson MC等人实验得出次氯酸可减少细胞组织的细菌污染并且抑制伤口感染。
2009年在上海召开的“微酸性电解水在食品产业中应用专题研讨会”极大地推动了次氯酸水在我国食品行业的推广和应用。
2013年日本将次氯酸水作为杀菌原料引入食品添加剂的新标准中，进一步规范了次氯酸水在食品行业的应用[15]
2016年美国食品药品监督管理局（FDA）已批准主要活性成分为次氯酸的产品用于治疗伤口和各种感染。
2017年美国华盛顿大学医学博士Stroman，D. W等人实验得出使用次氯酸加盐水的溶液可显著降低眼部皮肤细菌负荷，且不会改变残留在下眼睑皮肤上的细菌种类多样性。
同年3月，《医院消毒技术规范》（第二版），详细介绍了次氯酸水消毒剂的理化、杀菌机理、适用范围和使用方法等。次氯酸慢慢进入人们的视野。通过逐步的实验和多种研究，次氯酸在杀菌、稳定性和毒理等相关指标也逐步稳定。同时次氯酸，在医院、母婴等行业也逐渐开始使用，也认识到次氯酸（HClO）不仅可以消毒杀菌，还具有去甲醛的效果。
2020年美国疾控中心（CDC）发表了一份名为“CDC关于新型冠状病毒期间的清洁和消毒指南”。其中指出：根据以往难以杀灭病毒的数据，经美国环保署（EPA）批准的相关消毒产品有望有效对抗COVID-19。