世界学者在十字花科植物族、属的界定及科内系统演化关系方面已作了不少工作，研究的焦点集中在族的划分、属的划分和种的分类位置等方面。对于族的划分，几位学者曾试图提供一个自然系统。如Hayek将其划分为10族，1999年，Karsten Zunk 等通过分子生物技术研究Lepidieae中属的系统演化，聚类分析结果支持Hayek对该族划分的观点。Schulz分成19族，Janchen 则分为15族。周太炎等主要按Schulz的划分将中国的十字花科植物划分成10个族，而最新出版的Flora of China (vol 8)则没有划分族，为了便于比较，属的排列仍基本按照Schulz的系统，但作者同时强调该系统大部分是人为的，一些关系很近的属被放到不同的族中，而关系很远的属却放到了同一族中，例如长柄芥属、葶苈属、南芥属等据最近的分子学研究认为它们的关系很近，但被分别放到4个族中，而关系较远的独行菜属、荠属、菥蓂属却被划分到独行菜族中。[11]
对于属的界定工作也是争论最多的方面之一。《中国植物志》第33卷记载，十字花科全世界分布300属以上，约3200种，中国有95属、425种、124变种和9变型。Flora of China(vol 8)记载十字花科全世界330多个属，约3500种，中国有102属，412种。《中国高等植物》第五卷记载十字花科世界分布350属，3200余种，中国有104属，400余种，其中燥原荠属被庭荠属合并，棱果芥属被并入糖芥属等；同时也有几个新属建立，如须弥芥属（Crucihimalaya），Olimarabibopsis、Sinosophiopsis等。2003年吴征镒等编写的《中国被子植物科属综论》记载十字花科植物在世界有330（355-370）属，3500（3200-3400）种。在中国分布103属（内9属特有），421-432种（内116个特有种），并依Takhtajan采用的修订的系统分14族进行了分析。[11] 十字花科植物